GeneChip Scanner 3000 7G Система для микроматричного анализа

Описание

Рабочий процесс, проводимый системой GeneChip Scanner 3000 7G System, включает в себя амплификацию ДНК, далее фрагментацию и гибридизацию ДНК, затем лигирование, отмывку и визуализацию.

Эту систему можно приобрести с или без мощной компьютерной рабочей станции с четырехъядерными Xeon процессорами, сервера Affymetrix GeneChip Command Console (AGCC) и GeneChip AutoLoader.

Применение GeneChip Scanner в клинической практике:

• в пренатальной диагностике для поиска хромосомной патологии плода;
• в постанальной диагностике для детей со множественными пороками развития, задержкой развития, аутизмом;
• для анализа постабортного материала для установления причины потери беременности;
• в онкологии для исследования опухолевых клеток.

Применение GeneChip Scanner в агрогенетике:

• идентификация и паспортизизация сорта и породы сельскохозяйственных растений и животных;
• ДНК-скрининг селекционных маркеров при скрещивании и выявлении наследуемых патологий.

Принцип работы GeneChip Scanner

Для проведения хромосомного микроматричного анализа используется твердый носитель небольшого размера (микроматрица) из стекла или кремния. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды (8-80 нп) или фрагменты ДНК/РНК (более 100 нп).

Матрицы, используемые для хромосомного микроматричного анализа, содержат до 2,7 млн. специфических олигонуклеотидов. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. За счет высокой плотности маркеров можно определить минимальные потери/увеличение генетического материала всех регионов генома.

Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов (SNP), анализа копийности любых участков генома (CNV), определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов.

Особенности GeneChip Scanner 3000 7G

• компактный размер для лучшего использования пространства;
• сканирование с более высоким разрешением от 0,51 до 2,5 мкм пикселизации, автоматически выбираемые по типу микроматрицы;
• оптимальная однородность изображения и эффективность сбора всей области сканирования благодаря запатентованной технологии Applied Biosystems™ Flying Objective™;
• отсутствие дрейфа лазера и снижение вариабельности от сканера к сканеру;
• автоматическая регулировка коррекции остаточной дуги и x-линейности;
• совместимость с автозагрузчиком GeneChip Autoloader для самостоятельного сканирования до 48 микроматриц одновременно.