Секвенатор нуклеиновых кислот Геноскан 3700

Описание секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 3700

Секвенатор нуклеиновых кислот Геноскан 3700 — настольный высокопроизводительный NGS-секвенатор, созданный для широкого спектра задач: таргетного, экзомного и метагеномного секвенирования, секвенирования микробиома, онкопанелей и небольших геномов. Прибор построен на технологии секвенирования «по синтезу» с применением обратимых терминаторов и флуоресцентной детекции. В проточной ячейке происходит мостиковая амплификация, создающая кластеры ДНК, после чего циклически считываются сигналы при добавлении меченых нуклеотидов.

Система поддерживает разные типы проточных ячеек, обеспечивающих от 50 до 500 млн прочтений за запуск, что делает прибор подходящим как для небольших лабораторий, так и для крупных центров. В зависимости от режима чтения время запуска составляет: SE75 — около 4,5 ч; PE75 — 10,5 ч; PE150 — около 13 ч.

Геноскан 3700 совместим с популярными библиотечными протоколами (TruSeq/Nextera), имеет встроенный компьютер и ПО для управления, автоматическую промывку ячейки и онлайн-мониторинг качества. Наличие регистрационного удостоверения позволяет использовать прибор в клинической диагностике. Это сбалансированное решение по производительности, стоимости запуска и гибкости применения.

Особенности секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 3700

Комплекс возможностей прибора охватывает ключевые аспекты производительности, гибкости и удобства эксплуатации, обеспечивая эффективное применение в лабораториях различного профиля.

Производительность и режимы работы

Геноскан 3700 обеспечивает высокую гибкость по объёму данных благодаря использованию разных типов проточных ячеек. Пропускная способность составляет от 50 до 500 млн прочтений за запуск, что позволяет выбирать между малым, средним или повышенным объёмом секвенирования.
Прибор поддерживает до 600 циклов чтения, что подходит как для коротких чтений (например, диагностических панелей), так и для длинных paired-end протоколов, применяемых в экзомике и метагеномике.
Высокая скорость работы позволяет выполнять запуск в течение рабочего дня:

• SE75 — около 4,5 часа
• PE75 — около 10,5 часа
• PE150 — около 13 часов

Благодаря этому прибор подходит как для рутинных задач с быстрым оборотом образцов, так и для полноразмерных исследований.

Проточные ячейки

Секвенатор поддерживает широкий спектр проточных ячеек, рассчитанных на задачи разного масштаба. Конструкции с 2 или 4 независимыми дорожками позволяют запускать параллельно разные библиотеки или контролировать комбинации образцов без риска перекрёстного влияния.
Типы ячеек:

• FCL, FCX — компактные ячейки с 2 дорожками, удобны для малых и средних панелей;
• FCM, FCN, FCP — производительные ячейки с 4 дорожками, обеспечивают максимальный выход данных.

Этот подход делает систему универсальной и экономически гибкой — запускается только то, что требуется для задачи.

Гибкость библиотек

Прибор полностью совместим с библиотечными протоколами на базе TruSeq и Nextera, что обеспечивает беспроблемную интеграцию в существующие лабораторные процессы.
Геноскан 3700 подходит для различных типов NGS-приложений:

• таргетные панели генов;
• микробиологические исследования (16S, геномы бактерий/вирусов);
• онкогенетика;
• метагеномные исследования;
• полноэкзомное секвенирование.

Такой набор возможностей делает прибор универсальной платформой для лабораторий с широким спектром задач.

Автоматизация и удобство эксплуатации

Система выполнена в формате «всё-в-одном»: сам секвенатор, встроенный компьютер и программное обеспечение объединены в единый комплекс. Это упрощает установку и снижает требования к инфраструктуре.
Автоматическая промывка после завершения запуска снижает потребность в ручном обслуживании и уменьшает вероятность ошибок.
Интерфейс прибора включает онлайн-мониторинг параметров секвенирования, что позволяет контролировать качество данных в реальном времени и оперативно реагировать на критические отклонения.

Применение и надёжность

Геноскан 3700 подходит как для исследовательских задач, так и для клинической диагностики, что подтверждается наличием регистрационного удостоверения медицинского изделия.
Производитель обеспечивает стабильные поставки расходных материалов и реагентов, что снижает риск перебоев в работе лаборатории и обеспечивает надёжность результатов.
Благодаря сочетанию производительности, универсальности и удобства работы Геноскан 3700 является оптимальным решением для лабораторий с разными уровнями нагрузки — от специализированных диагностических центров до научно-исследовательских учреждений.

Варианты применения секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 3700

Геноскан 3700 сочетает высокую производительность с гибкостью конфигурации, что позволяет адаптировать прибор под задачи разного масштаба — от рутинных панелей до сложных геномных исследований.

Клиническая генетика

• Таргетные панели заболеваний (кардиогенетика, неврогенетика).
• Панели врождённых нарушений и наследственных синдромов.
• Поиск мутаций SNV/INDEL в генах, связанных с редкими заболеваниями.

Онкогенетика

• Онкопанели для выявления соматических мутаций.
• Тестирование драйверных мутаций в солидных опухолях и гематологических заболеваниях.
• Мониторинг минимальной остаточной болезни (MRD) при наличии соответствующих панелей.

Микробиология

• Определение состава микробных сообществ (16S/ITS).
• Поиск патогенов в образцах (бактерии, вирусы, грибы).
• Генотипирование линий микроорганизмов.

Метагеномика

• Полное метагеномное секвенирование сложных микробных сообществ.
• Анализ микробиоты человека, животных и среды.
• Исследования устойчивости и переносимости генов антибиотикорезистентности.

Экзомное секвенирование (WES)

• Анализ SNV/INDEL в кодирующих областях генома.
• Выявление патогенных вариантов при наследственных заболеваниях.

Малые геномы

• Секвенирование вирусов, бактерий и архей.
• Рутинная эпидемиологическая и клиническая геномика (например, SARS-CoV-2).

Исследовательские проекты

• Транскриптомика (RNA-seq) — для дифференциальной экспрессии.
• Генетические исследования популяций.
• Функциональная геномика и работа с гибкими панелями.