Секвенатор нуклеиновых кислот Геноскан 5000

Описание секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 5000

Секвенатор нуклеиновых кислот Геноскан 5000 — высокопроизводительная платформа нового поколения, предназначенная для масштабных задач геномики: полногеномного и полноэкзомного секвенирования, RNA-seq, метагеномики, крупных таргетных панелей и исследований микробиома. Прибор основан на технологии секвенирования «по синтезу» с использованием обратимых терминаторов и флуоресцентной детекции. В проточных ячейках выполняется мостиковая амплификация с формированием кластеров ДНК, а процесс чтения происходит циклично по мере добавления меченых нуклеотидов.

Геноскан 5000 оснащён двумя независимыми проточными ячейками, которые можно запускать как вместе, так и по отдельности, что обеспечивает гибкость загрузки и оптимизацию затрат. Максимальная производительность прибора достигает до 1200 Гб и до 4 млрд прочтений за запуск, что делает его подходящим для высоконагруженных научных и клинических центров.

Прибор поддерживает широкий спектр библиотечных протоколов, имеет автоматизированную систему подготовки и промывки ячеек, встроенный компьютер и удобное ПО для мониторинга и управления. Решение сочетает высокую мощность, устойчивость, универсальность и подходит для исследовательского применения и клинических задач (при наличии соответствующих разрешений).

Особенности секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 5000

Комплекс технических возможностей прибора охватывает ключевые аспекты: производительность, гибкость конфигурации, автоматизацию и надёжность, что делает систему универсальным инструментом для современных геномных лабораторий.

Производительность и режимы работы

Геноскан 5000 разработан для задач, где требуется большой объём данных в сочетании с высокой точностью.
Основные показатели:

• До 1200 Гб данных / запуск
• До 4 млрд прочтений
• Поддержка SE и PE режимов
• Подходит для проектов WGS, WES, RNA-seq и высоконагруженных панельных исследований
• Две ячейки работают параллельно или автономно, что позволяет разделять проекты и оптимизировать загрузку

Высокая производительность делает Геноскан 5000 идеальным решением как для крупных исследовательских программ, так и для лабораторий, работающих с большими пакетами клинических образцов.

Проточные ячейки

Геноскан 5000 использует новый класс проточных ячеек с улучшенной микрофлюидикой и высокой плотностью кластеризации. Возможны варианты с независимой работой, что позволяет запускать разные библиотеки в рамках одного цикла.
Типы ячеек:

• FCM — высокопроизводительная ячейка для масштабных проектов с максимальным выходом данных
• FCH — ячейка среднего объёма для RNA-seq, таргетных панелей и микробиологических исследований
• FCP — компактная ячейка для малых и средних проектов, оптимальна для отдельных библиотек и рутинных запусков

Такой подход делает Геноскан 5000 экономически гибкой системой: каждый запуск подстраивается под нужный объём данных.

Гибкость библиотек

Геноскан 5000 совместим с широким набором библиотечных протоколов, включая те, что используются на платформах Illumina (TruSeq/Nextera-подобные).
Прибор подходит для всех основных классов NGS-приложений:

• таргетные панели;
• микробиология (16S/ITS, геномы бактерий и вирусов);
• онкогенетика;
• метагеномика;
• полноэкзомное и полногеномное секвенирование (WES/WGS);
• транскриптомика (RNA-seq).

Автоматизация и удобство эксплуатации

Геноскан 5000 разработан как максимально удобная и автономная лабораторная система.
Основные элементы автоматизации:

• «Всё-в-одном»: встроенный компьютер, ПО и управляющая электроника
• Автоматическая промывка проточных ячеек
• Минимизация ручных операций
• Полный онлайн-мониторинг качества и параметров секвенирования
• Удобный графический интерфейс управления
• Это снижает требования к обслуживанию, уменьшает риск ошибок и ускоряет запуск.

Применение и надёжность

Геноскан 5000 ориентирован как на исследовательские задачи, так и на работу в клинико-диагностических лабораториях (при наличии рег. удостоверения).
Производитель обеспечивает стабильные поставки реагентов и расходных материалов, что повышает надёжность работы лаборатории и снижает риски остановки процессов.
Благодаря сочетанию высокой мощности, универсальности и удобства работы Геноскан 5000 является оптимальной платформой для высоконагруженных лабораторий, биомедицинских центров и исследовательских учреждений.

Варианты применения секвенатора нуклеиновых кислот Геноскан 5000

Возможности Геноскан 5000 позволяют решать задачи разной сложности — от рутинных панелей до масштабных геномных исследований.

Клиническая генетика

• Таргетные панели наследственных заболеваний
• Панели врождённых нарушений
• Поиск SNV/INDEL в генах, связанных с редкими заболеваниями

Онкогенетика

• Онкопанели различного масштаба
• Выявление соматических мутаций
• Анализ драйверных мутаций
• Мониторинг MRD (при наличии соответствующих библиотек)

Микробиология

• 16S/ITS
• Выявление патогенов
• Генотипирование бактерий и вирусов
• Секвенирование малых геномов

Метагеномика

• Полное метагеномное секвенирование
• Анализ микробиоты человека, животных и окружающей среды
• Исследование генов антибиотикорезистентности

Экзомное секвенирование (WES)

• Анализ SNV/INDEL в кодирующих областях
• Выявление патогенных мутаций при наследственных болезнях

Полногеномное секвенирование (WGS)

• Исследовательские и клинические задачи
• Популяционная генетика
• Эпидемиология и мониторинг штаммов

Исследовательские проекты

• RNA-seq и транскриптомика
• Популяционные и эволюционные исследования
• Функциональная геномика
• Гибкие мультиплексные панели