Генетические полиморфизмы: что показывает анализ и когда он нужен

Генетические полиморфизмы — это распространённые варианты последовательности ДНК, которыми люди могут отличаться друг от друга. Некоторые из них не оказывают заметного влияния на здоровье, другие связаны с особенностями обмена веществ, риском определённых заболеваний или реакцией на лекарственные препараты.

Исследование полиморфизмов позволяет определить конкретные генетические варианты, но важно понимать: обнаруженный вариант ДНК сам по себе обычно не является диагнозом.

Что такое полиморфизмы?

ДНК можно представить как длинную последовательность из четырёх нуклеотидов — A, T, G и C. В определённых участках этой последовательности у разных людей могут встречаться разные варианты.

Один из наиболее распространённых типов таких различий — однонуклеотидный полиморфизм, или SNP. В этом случае отличие затрагивает одну позицию ДНК: например, у одного человека в определённом участке находится один нуклеотид, а у другого — другой.

Большинство подобных вариантов являются частью естественного генетического разнообразия человека.

Для определения полиморфизмов применяются молекулярно-генетические методы. В зависимости от задачи это может быть ПЦР, генотипирование или другие технологии исследования ДНК.

Что показывает анализ на полиморфизмы?

Результат исследования отвечает прежде всего на вопрос: какой вариант определённого участка ДНК присутствует у человека.

При этом важно разделять три понятия:

• генетический вариант — особенность последовательности ДНК;
• генетическая предрасположенность — изменение вероятности определённого состояния;
• заболевание — клинический диагноз, который устанавливается на основании симптомов, анамнеза и результатов обследования.

Поэтому фраза «обнаружен полиморфизм» сама по себе ещё не говорит о наличии болезни.

Практическая ценность теста зависит от того, какой именно ген исследуется, какой вариант обнаружен и насколько хорошо доказано его клиническое значение.

Полиморфизмы и наследственная склонность к тромбозам

Одно из направлений, где генетическое исследование может иметь клиническое значение, — оценка некоторых наследственных факторов риска венозных тромбозов.

К наиболее известным относятся определённые варианты:

• гена F5, кодирующего фактор V свёртывания крови, в том числе фактор V Лейдена;
• гена F2, кодирующего протромбин.

Наличие таких вариантов может быть связано с повышенным риском венозной тромбоэмболии. Однако даже их обнаружение не означает, что у человека обязательно возникнет тромбоз.

На общий риск одновременно влияют возраст, операции, длительная неподвижность, беременность, приём некоторых гормональных препаратов, сопутствующие заболевания и другие факторы.

Поэтому обследование на наследственную тромбофилию назначается не всем подряд. Врач оценивает личный и семейный анамнез, обстоятельства возникновения тромбоза и то, повлияет ли результат анализа на дальнейшую тактику.

Нужно ли исследовать полиморфизмы при планировании беременности?

Генетические исследования могут использоваться в отдельных клинических ситуациях, например при наличии у женщины или её близких родственников венозных тромбозов.

Однако расширенное исследование множества полиморфизмов не является универсальным анализом для всех женщин, планирующих беременность.

Также наличие генетического варианта нельзя автоматически считать причиной невынашивания беременности или других репродуктивных осложнений. Решение о необходимости обследования принимается с учётом анамнеза и других факторов риска.

Особого внимания заслуживают распространённые варианты гена MTHFR. Они часто входят в коммерческие панели «генов фолатного цикла», однако выявление распространённых полиморфизмов MTHFR само по себе не подтверждает наследственную тромбофилию и не должно интерпретироваться как доказательство причины тромбозов или невынашивания беременности.

А что насчёт гормонального обмена?

Существуют панели, включающие варианты генов рецепторов и ферментов, участвующих в гормональной регуляции и обмене веществ. Например, могут исследоваться ESR1, ESR2, AR, CYP1A1, CYP1B1, COMT и другие гены.

Отдельные варианты действительно изучаются в связи с эндометриозом, особенностями репродуктивной функции и другими многофакторными заболеваниями.

Но здесь особенно важно отличать научную ассоциацию от клинического теста.

Если определённый вариант чаще встречается у людей с каким-либо заболеванием, это ещё не означает, что именно он стал причиной болезни у конкретного пациента. Подобный результат сам по себе не позволяет диагностировать СПКЯ, эндометриоз, бесплодие, нарушение менструального цикла, акне или гирсутизм.

Поэтому генетические панели не заменяют стандартное обследование, которое может включать оценку симптомов, анамнеза, гормональных показателей и инструментальную диагностику.

Фармакогенетика: почему генетика может быть важна при лечении

Ещё одно направление применения генетических исследований — фармакогенетика.

Некоторые генетические варианты способны влиять на работу ферментов и транспортных белков, которые участвуют в превращении и выведении лекарственных веществ.

В результате один и тот же препарат у разных людей может:

• достигать разной концентрации в организме;
• действовать с разной эффективностью;
• иметь различную вероятность нежелательных реакций.

Для ряда конкретных сочетаний «ген — лекарственный препарат» существуют клинически значимые данные. В таких случаях генетическая информация может использоваться врачом при выборе препарата или режима его применения.

Но фармакогенетический тест также не является универсальным ответом на вопрос «какое лекарство мне подходит». Возраст, состояние печени и почек, сопутствующие заболевания, другие принимаемые препараты и множество дополнительных факторов остаются не менее важными.

Полиморфизмы и риск распространённых заболеваний

Некоторые генетические варианты изучаются в связи с сердечно-сосудистыми, онкологическими, эндокринными и метаболическими заболеваниями.

Но большинство распространённых заболеваний являются многофакторными. Это означает, что на их развитие одновременно влияют множество генетических вариантов и внешних факторов.

К ним относятся:

• возраст;
• образ жизни;
• питание;
• курение;
• физическая активность;
• масса тела;
• сопутствующие заболевания;
• факторы окружающей среды.

Поэтому наличие одного «рискового» полиморфизма обычно не позволяет предсказать, разовьётся заболевание или нет.

Даже если вариант ДНК статистически связан с определённым состоянием, он не обязательно является непосредственной причиной заболевания.

Почему важна правильная интерпретация анализа?

Генетический результат нельзя оценивать только по принципу «хороший» или «плохой» вариант.

Врач учитывает:

• какой именно ген и вариант исследован;
• насколько убедительно доказано его клиническое значение;
• есть ли у пациента соответствующие симптомы;
• были ли подобные заболевания у родственников;
• результаты других лабораторных исследований;
• данные инструментальной диагностики;
• изменит ли результат дальнейшее наблюдение или лечение.

Иногда после генетического исследования действительно требуется дополнительная диагностика. Но её объём определяется конкретной клинической ситуацией, а не только обнаруженным полиморфизмом.

Когда врач может назначить исследование полиморфизмов?

Такой анализ может рассматриваться, например:

• при тромбозах, особенно повторных, возникших в молодом возрасте или в необычной локализации;
• при выраженном семейном анамнезе тромбозов или других наследственных состояний;
• если у родственника уже выявлен конкретный клинически значимый генетический вариант;
• перед применением некоторых лекарственных препаратов, для которых имеет значение генотип пациента;
• при обследовании по поводу определённых наследственных заболеваний;
• в отдельных ситуациях при планировании беременности, если имеются соответствующие факторы риска.

При этом сдавать большую панель генетических полиморфизмов «на всякий случай» не всегда полезно. Чем больше вариантов исследуется, тем выше вероятность обнаружить особенности, клиническое значение которых ограничено или пока окончательно не установлено.

Что важно запомнить?

Генетические полиморфизмы есть у каждого человека. Большинство из них являются обычной частью генетического разнообразия и сами по себе не свидетельствуют о заболевании.

Некоторые генетические варианты действительно имеют доказанное медицинское значение — например, при оценке отдельных наследственных факторов риска тромбозов или в фармакогенетике.

В других случаях анализ показывает лишь возможную предрасположенность или статистическую ассоциацию.

Поэтому главный вопрос перед генетическим исследованием — не просто «какие у меня полиморфизмы?», а «какую клиническую информацию даст этот анализ и изменит ли его результат дальнейшую тактику?».

Результаты генетических исследований следует интерпретировать вместе с врачом с учётом симптомов, анамнеза и других данных обследования. Не следует самостоятельно начинать, отменять или изменять лечение только на основании обнаруженного полиморфизма.